高新技术企业认证申报程序，研发项目的选择、确定及证明材料准备：确定可证明公司科研能力的近三年的研发项目；根据已确定的研发项目确定高新领域(目录第三级)；根据确定的项目准备立项报告、RD、PS表等技术资料；确定项目对应的成果转化资料并补充；确定需要备案的技术服务合同并安排备案；企业高新技术产品(服务)的关键技术与技术指标的具体说明书。
高新技术企业认证申报程序，研发费用归集、高新收入确认：根据确定的项目做出近三年研发费用做出审计报告及匡算近三年的营业收入审计报告；确定实际高新收入比例，高新产品收入要占到总收入的60%以上。
高新技术企业认证申报程序，人事部门、行政部门制度材料的整理：确认员工名册以及科技人员的比例，研发人员比例不低于总职工的10%。整理部分科技人员学历、职称证书；准备上一年度社保缴纳证明；整理企业研发管理水平的证明材料，包括研发项目组织管理制度、研发投入核算体系、产学研协议、科技成果转化组织实施与激励奖励制度、科技人员绩效考核制度等；整理研发设备清单及购买发票。
高新技术企业认证申报程序，申报及后续跟进：整体梳理确认申报材料;网上填写并申报;提交材料，后续跟进;申报成功后，每年及时填报火炬系统;连续两年不填，高新将被取消。
