1、依据不同的吸气控制方式，可以将大鼠呼吸机分为压力控制型呼吸机和容量控制型呼吸机，在临床呼吸机领域，压力控制更主流一些。在但动物实验领域，相当多的用户习惯设置潮气量进行容积控制。
2、依据大鼠呼吸机的结构原理，可分为活塞式呼吸机和电磁阀式呼吸机。一般活塞式呼吸机使用容积控制，而电磁阀式呼吸机即可以进行容控制，也可以进行压力控制。
3、依据调控方式不同，可分为电动电控型和气动电控型呼吸机。
因为具有不同的呼吸机，其实他们给动物的通气方式也是不同的，根据通气方式不同，我们可以将通气方式分为：
控制模式（CV）：呼吸机*替代实验动物的呼吸，其呼吸频率，潮气量均由呼吸机控制，属于*的呼吸支持。适用于自主呼吸消失或很微弱的情况，比较典型的应用，就是动物的开胸手术实验。根据控制参数的不同，控制通气又可以分为容量控制通气(VCV）和压力控制通气(PCV)。容量控制通气(VCV）是呼吸机按预置的潮气量、呼吸频率、呼吸比等参数完成通气。压力控制通气(PCV)则是呼吸机按照预置的频率、呼吸比、吸气压力工作。
辅助通气（AV）：呼吸机的送气是通过呼吸机检测实验动物的气道压的降低来触发。辅助通气是一种与临床应用类似的呼吸方式，动物的辅助通气一般可以通过设置压力触发、人工触发或定时触发等方式启动。对于动物呼吸机而言，辅助通气(AV）是一种较高级的呼吸模式，仅少量动物呼吸机具体此功能。
叹气模式(sigh)：是一种在常规呼吸通气条件下，隔一段时间进行一次深呼吸的通气方式。通常实验动物在长期使用控制通气，尤其是容量控制通气条件下，某些边缘肺泡会膨胀不全，肺部功能会逐步减弱，加入定时或手工叹气，可防止肺部萎陷不张，改善气体交换性能。
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