汇缴与财报口径差异大：Z公司填报的研发费用加计扣除金额，远大于其财务报表中管理费用的金额，且与高新技术企业资格认定标准中的研发费用金额差异较大。
研发费用归集不规范：Z公司的研发费用辅助账只有各费用的总和，没有明细记录，且Z公司加计扣除申报的研发项目众多，而当年申报高新技术企业时提交的研发项目数量较少。
注重研发费日常管理：一方面，规范研发项目的管理，注意研发费用加计扣除申报资料与高新技术企业申报资料的一致性。如果两者的研发项目在数量、内容上差异过大，且缺少合理的解释，税务机关可能会对企业申报资料的真实性产生怀疑。
另一方面，实现研发费用的核算管理日常化。企业应制定一套完整的研发费用核算体系，完善研发费用辅助账，将研发费用的核算管理日常化。企业研发部门应将项目产生的费用明细，包括项目名称、项目人员、费用发生日期等信息及时反馈到财务部门，财务部门应及时统计研发费用，确定好研发费用分摊方法，编制好相应的研发费用辅助账，为研发费用加计扣除和高新技术企业资格认定申报打好基础。
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